普佑寺是普寧寺的附屬寺廟，建于清乾隆二十五年，是向外八廟的眾喇嘛講經說法的主要場所（相當于現在的經學院）。曾經設有四學，包括講顯宗經學、密宗經學、歷算學和醫藥學。但寺中最值得一看的是500羅漢雕像，神態各異，極具藝術價值（只剩下176尊）。這里不但培養外八廟的喇嘛，蒙古各部的喇嘛也選送到這里學經。學經費用全部由清政府提供。當時，這里不僅是喇嘛云集研習佛教經典、理論的經學院，也是進行宗教活動的重要場所。殿內供奉的佛像，也與其它寺廟不同，有漢式的，也有藏式的。是外八廟中別具一格的廟宇

        普佑寺與普寧寺相通，普寧寺的上一任活佛主持哈木爾活佛就是在這里寺廟的主殿臺基上進行的火化，半空當中出現了五彩祥云，活佛的舍利先供奉在普寧寺的大雄寶殿之中。